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一个好用的查找PCR引物的网站

时间:2023-06-04 23:42:02 | 来源:网站运营

时间:2023-06-04 23:42:02 来源:网站运营

一个好用的查找PCR引物的网站:

作为科研菜鸟的我,最近超级烦心的事情,是某个目的基因始终找不到好的引物,自己在线设计的、生工网站在线设计的、文献查找的、前前后后一共10个,都不能用。

被逼急的我,和小方姐姐说:我要在这几个引物里硬挑一个,很硬很硬的挑。

小方姐姐白眼:怎么挑?我看你是要表演杂技了!

好的,果然,硬不起来。。。

不过,终于,让我找到了一个好用的网站。都不用自己设计,直接输入NCBI GeneID就可以啦。一共给了5个引物,test了一下全都可以用!

好的,和大家简单分享一下,网站就是PrimerBank,百度一下就有网址了。

但首先,要在pubmed上查到目的基因的NCBI GeneID。pubmed就不说了,拖到网页下方有一个Gene,点击进入。

然后在搜索栏输入你要查找的目的基因,以 mouse的IL-6为例。search~

然后你就会看到mouse IL-6 的ID:16193。记住这个数字。

百度搜索PrimerBank,进入网站。长这样~

然后,将search by 改成NCBI Gene ID,物种选择你需要的,这里我以mouse为例,For Test 输入刚才查到的gene ID。submit~

之后,你就可以得到好几个引物序列。

当然,你可以用NCBI中的Blast验证引物的特异性,但是,我觉得也就没几个,就都合成了一下,并用PCR验证了特异性。超棒,5个序列全都可以!

一点科研体验,与大家分享,希望大家多多指导,谢谢。

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